The Black Forest

1. Arduenn commented on 2005/5/26, 20.52 h:

Homo

Chimp (similar to GAPDH, waarschijnlijk echte GAPDH, maar nog nooit functioneel bestudeerd.

Nergens Bonobo (Pan paniscus) te vinden. Dat begint al goed.

2. Arduenn commented on 2005/5/26, 20.58 h:

Een stukje GAPDH van de regenwurm

3. Dave commented on 2005/5/26, 23.31 h:

Hoever kom je met het gen voor aceetaldehyde dehydratase? ik moet die code ergens hebben liggen. Is misschien wel aardig, want in mijn genoom heb ik die code niet.

4. Arduenn commented on 2005/5/27, 8.07 h:

Gek, die vind ik niet met Google. Heb je het hele gen niet, of zijn er een paar lettertjes bij jou fout?

5. jorrit commented on 2005/5/27, 8.38 h:

Staph. aureus heeft alleen gapB en gapC

@dave: drink je daarom geen alcohol?

Volgens mij heeft zelfs E. coli acetaldehyde dehydrogenase. Daar moet je een heel eind mee kunnen komen.

6. Arduenn commented on 2005/5/27, 8.55 h:

dehydrogenase, vandaar dat ik het niet kon vinden... Btw. Pilsje, Dave?

7. Arduenn commented on 2005/5/27, 8.58 h:

Mens...

8. jorrit commented on 2005/5/27, 9.13 h:

glasaal "similarities with GAPDH"

9. Arduenn commented on 2005/5/27, 9.19 h:

GAPDH dan toch maar? Ik zie net dat ze het naast GAPDH en G3PDH ook wel eens G3PT noemen.

10. Oersoep commented on 2005/5/27, 16.37 h:

Het gen voor eeehm... transcriptase is ook wel een aardige toch? Ze moeten allemaal hun DNA repliceren, lijkt mij, of verschilt dat mechnisme?

11. Arduenn commented on 2005/5/27, 16.48 h:

Eigenlijk wel een briljant idee. (Je bedoelt DNA-polymerase, toch?) Kunnen we er zelfs een aantal virussen tegenaan gooien.

12. Dave commented on 2005/5/28, 21.58 h:

Ja, ik hoor de Netwerk-fearmachine al! "Stamt de mens af van een HIV-achtig virus? Dat en meer, straks, in Netwerk."

13. Arduenn commented on 2005/5/29, 8.16 h:

Nou lach je daar wel om, maar 2,2% van al ons DNA komt van HIV-achtige virussen. Met andere woorden, in elke cel van ons lichaam zeulen we 3.000.000.000 x 0,022 = 66.000.000 baseparen aan retroviraal DNA mee. Een retrovirus is gemiddeld 11.000 basen lang, dus dat zijn zo'n 6000 verschillende virussen waar we van gemaakt zijn. En dat zijn alleen maar retrovirale sequenties.

(HIV heeft trouwens geen DNA-afhankelijke DNApol).

14. Dave commented on 2005/5/29, 19.28 h:

Ik vond de discussie bij ons thuis in "diepe" overigens buitengewoon boeiend, en het was heel typisch zoals die Taco over alle tegenwerpingen heen las. Een kwestie van geloof, natuurlijk.

"(HIV heeft trouwens geen DNA-afhankelijke DNApol)." Nee, ja, dat is waar ook, maar hoe zat dat ook al weer?

En virussen slepen natuurlijk ook veel van de menselijke code met zich mee.

enne...

15. Arduenn commented on 2005/5/29, 19.46 h:

HIV heeft een RNA/DNA-afhankelijk DNA-polymerase: reverse transcriptase, dat van RNA DNA kan maken.

Dat valt dan ook wel weer zwaar tegen hoor. Alleen pokken- en herpesvirussen.

16. Arduenn commented on 2005/5/29, 19.51 h:

Whoa. miRNA, toen ik dat in de figuurlegende las dacht ik, is dat een typfout? Weer een nieuwe RNA erbij. Wat hebben we nu allemaal? mRNA, tRNA, rRNA, siRNA en nu miRNA. Weer wat geleerd.